Sono della caduta dell'Impero Romano le prime testimonianze della nascita del primo villaggio, proprio quando la Terra d'Otranto, dovette subire, dal V all'XI secolo, un lungo periodo di guerre e distruzioni ad opera dei diversi popoli (Barbari, Saraceni, ecc...) .Successivamente Ruffano appartenne sino al 1463 sotto il principato di Taranto. In seguito divenne feudo dei Ruffa, dei Colonna, degli Antoglietta, dei Falconi, dei Filomarino, dei Brancaccio ed, in ultimo, dei Ferrante che diedero notevole lustro e prestigio alla città.
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